Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA1P49639 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA1P49639 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms