Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCT3P49368 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCT3P49368 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCT3P49368 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCT3P49368 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCT3P49368 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCT3P49368 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCT3P49368 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCT3P49368 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCT3P49368 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms