Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCP4P48539 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCP4P48539 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCP4P48539 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCP4P48539 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCP4P48539 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCP4P48539 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCP4P48539 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCP4P48539 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCP4P48539 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCP4P48539 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCP4P48539 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCP4P48539 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms