Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC4P43686 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMC4P43686 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMC4P43686 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms