Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAD52P43351 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD52P43351 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD52P43351 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD52P43351 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD52P43351 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD52P43351 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAD52P43351 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAD52P43351 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAD52P43351 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAD52P43351 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms