Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDIT3P35638 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDIT3P35638 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDIT3P35638 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms