Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT9P35527 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT9P35527 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT9P35527 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT9P35527 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT9P35527 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms