Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC1P35052 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPC1P35052 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC1P35052 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC1P35052 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC1P35052 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPC1P35052 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPC1P35052 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms