Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RYKP34925 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RYKP34925 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RYKP34925 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RYKP34925 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RYKP34925 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RYKP34925 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RYKP34925 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RYKP34925 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms