Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA9P31269 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms