Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB6P28072 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms