Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGB2P26583 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HMGB2P26583 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB2P26583 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB2P26583 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB2P26583 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB2P26583 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB2P26583 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGB2P26583 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB2P26583 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB2P26583 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB2P26583 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HMGB2P26583 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGB2P26583 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMGB2P26583 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms