Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTAFRP25105 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms