Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRBP23467 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRBP23467 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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