Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNI3P19429 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms