Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA4P13612 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms