Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1P11387 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1P11387 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1P11387 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOP1P11387 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOP1P11387 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1P11387 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1P11387 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms