Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RD3LP0DJH9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RD3LP0DJH9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms