Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA6AP0CW24 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA6AP0CW24 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms