Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms