Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC3P02656 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOC3P02656 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOC3P02656 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOC3P02656 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC3P02656 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC3P02656 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOC3P02656 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms