Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNC2P02585 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNC2P02585 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNC2P02585 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms