Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms