Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STAMBPO95630 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STAMBPO95630 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STAMBPO95630 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STAMBPO95630 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STAMBPO95630 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms