Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETM1O95202 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETM1O95202 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LETM1O95202 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LETM1O95202 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETM1O95202 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETM1O95202 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM1O95202 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM1O95202 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms