Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN1O94985 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSTN1O94985 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN1O94985 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms