Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEBLO76041 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEBLO76041 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEBLO76041 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEBLO76041 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEBLO76041 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEBLO76041 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEBLO76041 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEBLO76041 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms