Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA2O75334 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms