Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIN3BO60391 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIN3BO60391 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN3BO60391 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms