Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR3O43761 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR3O43761 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms