Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLOCKO15516 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLOCKO15516 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms