Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARPC5O15511 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARPC5O15511 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms