Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1CO15160 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLR1CO15160 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms