Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRF2O14827 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRF2O14827 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms