Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRTO14522 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRTO14522 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRTO14522 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
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