Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO1FO00160 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1FO00160 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms