Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRRM3A6NNA2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRM3A6NNA2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms