Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSDA5PKW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSDA5PKW4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms