Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
A0A0U1RRA0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms