Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A0B4J293 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0B4J293 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms