Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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ARL2-SNX15V9GYD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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