Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AUP1Q9Y679 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AUP1Q9Y679 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AUP1Q9Y679 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AUP1Q9Y679 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AUP1Q9Y679 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AUP1Q9Y679 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AUP1Q9Y679 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AUP1Q9Y679 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AUP1Q9Y679 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AUP1Q9Y679 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AUP1Q9Y679 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AUP1Q9Y679 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms