Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPG1Q9Y678 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
COPG1Q9Y678 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPG1Q9Y678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPG1Q9Y678 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPG1Q9Y678 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPG1Q9Y678 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPG1Q9Y678 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG1Q9Y678 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COPG1Q9Y678 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms