Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GTF3C3Q9Y5Q9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
GTF3C3Q9Y5Q9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GTF3C3Q9Y5Q9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GTF3C3Q9Y5Q9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GTF3C3Q9Y5Q9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
GTF3C3Q9Y5Q9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GTF3C3Q9Y5Q9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GTF3C3Q9Y5Q9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GTF3C3Q9Y5Q9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms