Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHTOPQ9Y3Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHTOPQ9Y3Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHTOPQ9Y3Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHTOPQ9Y3Y2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHTOPQ9Y3Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHTOPQ9Y3Y2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms