Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERGIC3Q9Y282 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERGIC3Q9Y282 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC3Q9Y282 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC3Q9Y282 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC3Q9Y282 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERGIC3Q9Y282 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERGIC3Q9Y282 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERGIC3Q9Y282 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms