Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP24Q9UPU5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP24Q9UPU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP24Q9UPU5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP24Q9UPU5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP24Q9UPU5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP24Q9UPU5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP24Q9UPU5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP24Q9UPU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP24Q9UPU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP24Q9UPU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms