Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEFF2Q9UIK5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEFF2Q9UIK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEFF2Q9UIK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEFF2Q9UIK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEFF2Q9UIK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEFF2Q9UIK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEFF2Q9UIK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEFF2Q9UIK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEFF2Q9UIK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEFF2Q9UIK5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEFF2Q9UIK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEFF2Q9UIK5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms