Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB9Q9UBS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJB9Q9UBS3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB9Q9UBS3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB9Q9UBS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB9Q9UBS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB9Q9UBS3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJB9Q9UBS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJB9Q9UBS3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJB9Q9UBS3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAJB9Q9UBS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAJB9Q9UBS3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAJB9Q9UBS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DNAJB9Q9UBS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms