Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABRACLQ9P1F3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABRACLQ9P1F3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABRACLQ9P1F3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABRACLQ9P1F3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABRACLQ9P1F3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABRACLQ9P1F3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABRACLQ9P1F3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABRACLQ9P1F3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1098.8 ms